گونه هدف نئومایسین باکتریهای گرم منفی هوازی مانند اشریشیاکلای، سالمونلا، پروتئوس و کلبسیلا و برخی از باکتریهای گرم مثبت هوازی میباشند. این دارو جهت درمان آنتریت و اسهال دام و طیور ناشی از باکتریهای گرم منفی هوازی تجویز میشود.