سومین روش اساسی برای استریل کردن، جدا کردن فیزیکی میکروارگانیسم‌ها از موادی است که باید استریل گردند. بدین ترتیب این روش منحصر به استریلیزاسیون گازها و مایعات می‌گردد.
درواقع تولید شیر پاستوریزه اهدافی را دنبال می‌کند که همگی آنها در راستای ازبین بردن آلودگی‌های شیر می‌باشد.